我科學家發(fā)布蘋果屬遺傳多樣性全景圖
記者從中國農(nóng)業(yè)大學獲悉:近日,,該校教授韓振海團隊聯(lián)合國內(nèi)外團隊,基于30份蘋果屬物種高質(zhì)量基因組,,系統(tǒng)解析了蘋果屬數(shù)千萬年的演化歷程,,并構(gòu)建了首個蘋果屬圖形泛基因組,發(fā)布了蘋果屬遺傳多樣性全景圖,。這一成果發(fā)表于期刊《自然—遺傳》,。
這項研究發(fā)現(xiàn),蘋果屬可劃分為7個系統(tǒng)發(fā)育類群,,其起源可追溯至約5600萬年前的亞洲地區(qū),。作為重要的溫帶果樹,栽培蘋果的遺傳基礎相對狹窄,,但是通過構(gòu)建蘋果屬圖形泛基因組,,研究團隊發(fā)現(xiàn)蘋果屬的30多個物種具有豐富的遺傳多樣性,是天然的蘋果抗性基因庫,。
研究鑒定出物種特異的結(jié)構(gòu)變異,,并開發(fā)了一套選擇清除分析流程,用于挖掘與馴化相關(guān)的關(guān)鍵基因位點,。例如,,研究團隊在多花海棠中發(fā)現(xiàn)一個基因組的結(jié)構(gòu)變異,很可能與抗蘋果黑星病密切相關(guān),,還成功鑒定到影響蘋果耐寒性和抗病性的關(guān)鍵馴化基因,。這些“黃金”遺傳位點的發(fā)現(xiàn)不僅深化了對蘋果馴化過程中功能性變異的理解,也為培育抗逆蘋果品種提供了重要的基因資源,。
《自然—遺傳》對該成果進行重點推介,。西班牙農(nóng)業(yè)基因組研究中心一名科學家評價指出,該研究憑借其高質(zhì)量基因組和圖形泛基因組的構(gòu)建,,為蘋果研究與育種提供了卓越的資源支撐,,并顯著增進了對蘋果屬復雜系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和進化歷程的認知。